Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC43Q96MW1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC43Q96MW1 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms