Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PRRC1Q96M27 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRRC1Q96M27 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms