Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms