Protein–RNA interactions for Protein: Q96FW1

OTUB1, Ubiquitin thioesterase OTUB1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB1Q96FW1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTUB1Q96FW1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms