Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEIL1Q96FI4 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms