Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SMIM12Q96EX1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM12Q96EX1 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM12Q96EX1 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM12Q96EX1 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM12Q96EX1 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM12Q96EX1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM12Q96EX1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM12Q96EX1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM12Q96EX1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM12Q96EX1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM12Q96EX1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM12Q96EX1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM12Q96EX1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM12Q96EX1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM12Q96EX1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM12Q96EX1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM12Q96EX1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM12Q96EX1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM12Q96EX1 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM12Q96EX1 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM12Q96EX1 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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