Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms