Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms