Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HPS3Q969F9 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms