Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF0

SRSF12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF12Q8WXF0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms