Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

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Length 659 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
SSH3Q8TE77 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSH3Q8TE77 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
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