Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms