Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms