Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PNLDC1Q8NA58 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms