Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DTX3Q8N9I9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms