Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC33Q8N5R6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC33Q8N5R6 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC33Q8N5R6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC33Q8N5R6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC33Q8N5R6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC33Q8N5R6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC33Q8N5R6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC33Q8N5R6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms