Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHCHD4Q8N4Q1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
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