Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00518Q8N0U6 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00518Q8N0U6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00518Q8N0U6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00518Q8N0U6 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00518Q8N0U6 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00518Q8N0U6 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00518Q8N0U6 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00518Q8N0U6 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00518Q8N0U6 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00518Q8N0U6 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00518Q8N0U6 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00518Q8N0U6 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00518Q8N0U6 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00518Q8N0U6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00518Q8N0U6 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00518Q8N0U6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00518Q8N0U6 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00518Q8N0U6 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00518Q8N0U6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00518Q8N0U6 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00518Q8N0U6 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00518Q8N0U6 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00518Q8N0U6 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00518Q8N0U6 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00518Q8N0U6 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00518Q8N0U6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00518Q8N0U6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00518Q8N0U6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms