Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HERC6Q8IVU3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HERC6Q8IVU3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERC6Q8IVU3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms