Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms