Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKAP1Q86WV1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms