Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.27■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.27■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.27■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.27■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms