Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT9

SLC29A4, Equilibrative nucleoside transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4Q7RTT9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC29A4Q7RTT9 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC29A4Q7RTT9 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC29A4Q7RTT9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC29A4Q7RTT9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC29A4Q7RTT9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC29A4Q7RTT9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC29A4Q7RTT9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC29A4Q7RTT9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC29A4Q7RTT9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC29A4Q7RTT9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC29A4Q7RTT9 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC29A4Q7RTT9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC29A4Q7RTT9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC29A4Q7RTT9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC29A4Q7RTT9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC29A4Q7RTT9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC29A4Q7RTT9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC29A4Q7RTT9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC29A4Q7RTT9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC29A4Q7RTT9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC29A4Q7RTT9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC29A4Q7RTT9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC29A4Q7RTT9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC29A4Q7RTT9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC29A4Q7RTT9 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC29A4Q7RTT9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC29A4Q7RTT9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC29A4Q7RTT9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC29A4Q7RTT9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC29A4Q7RTT9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC29A4Q7RTT9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC29A4Q7RTT9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC29A4Q7RTT9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC29A4Q7RTT9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC29A4Q7RTT9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC29A4Q7RTT9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC29A4Q7RTT9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC29A4Q7RTT9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC29A4Q7RTT9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC29A4Q7RTT9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms