Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BEND4Q6ZU67 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BEND4Q6ZU67 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BEND4Q6ZU67 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BEND4Q6ZU67 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms