Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms