Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms