Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms