Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR3

TYW3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYW3Q6IPR3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TYW3Q6IPR3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms