Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 AC092964.1-201ENST00000623304 1399 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CHIC1Q5VXU3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 AC109466.1-206ENST00000522686 774 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CHIC1Q5VXU3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms