Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF3Q5VWG9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms