Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRCH2Q5VUJ6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms