Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q5VSD8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q5VSD8 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q5VSD8 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q5VSD8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q5VSD8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q5VSD8 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q5VSD8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q5VSD8 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q5VSD8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q5VSD8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q5VSD8 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q5VSD8 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q5VSD8 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q5VSD8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q5VSD8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q5VSD8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q5VSD8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q5VSD8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q5VSD8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q5VSD8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q5VSD8 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q5VSD8 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q5VSD8 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q5VSD8 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q5VSD8 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q5VSD8 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q5VSD8 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q5VSD8 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q5VSD8 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q5VSD8 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q5VSD8 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q5VSD8 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q5VSD8 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q5VSD8 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q5VSD8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q5VSD8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q5VSD8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q5VSD8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Q5VSD8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q5VSD8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q5VSD8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q5VSD8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q5VSD8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q5VSD8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q5VSD8 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q5VSD8 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q5VSD8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q5VSD8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q5VSD8 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q5VSD8 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q5VSD8 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q5VSD8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q5VSD8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q5VSD8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q5VSD8 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Q5VSD8 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q5VSD8 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q5VSD8 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q5VSD8 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q5VSD8 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q5VSD8 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q5VSD8 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Q5VSD8 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q5VSD8 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q5VSD8 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q5VSD8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q5VSD8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q5VSD8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q5VSD8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q5VSD8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q5VSD8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q5VSD8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q5VSD8 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q5VSD8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q5VSD8 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q5VSD8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q5VSD8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Q5VSD8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q5VSD8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q5VSD8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q5VSD8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q5VSD8 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q5VSD8 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q5VSD8 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q5VSD8 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Q5VSD8 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q5VSD8 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q5VSD8 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q5VSD8 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q5VSD8 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q5VSD8 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q5VSD8 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q5VSD8 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q5VSD8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q5VSD8 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q5VSD8 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q5VSD8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q5VSD8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q5VSD8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms