Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C10orf55Q5SWW7 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C10orf55Q5SWW7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C10orf55Q5SWW7 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C10orf55Q5SWW7 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C10orf55Q5SWW7 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C10orf55Q5SWW7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C10orf55Q5SWW7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C10orf55Q5SWW7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C10orf55Q5SWW7 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C10orf55Q5SWW7 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
C10orf55Q5SWW7 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C10orf55Q5SWW7 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C10orf55Q5SWW7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C10orf55Q5SWW7 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C10orf55Q5SWW7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C10orf55Q5SWW7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms