Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms