Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms