Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms