Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms