Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RFTN2Q52LD8 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms