Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4orf46Q504U0 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms