Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NBPF1Q3BBV0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NBPF1Q3BBV0 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms