Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.33■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM71Q2Q1W2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms