Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC27Q2M243 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms