Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q1T7F1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q1T7F1 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q1T7F1 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q1T7F1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q1T7F1 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q1T7F1 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q1T7F1 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q1T7F1 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q1T7F1 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q1T7F1 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q1T7F1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q1T7F1 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q1T7F1 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q1T7F1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q1T7F1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q1T7F1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q1T7F1 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q1T7F1 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q1T7F1 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q1T7F1 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q1T7F1 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q1T7F1 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q1T7F1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q1T7F1 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q1T7F1 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q1T7F1 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q1T7F1 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q1T7F1 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q1T7F1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q1T7F1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Q1T7F1 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Q1T7F1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Q1T7F1 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Q1T7F1 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Q1T7F1 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Q1T7F1 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Q1T7F1 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Q1T7F1 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Q1T7F1 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Q1T7F1 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Q1T7F1 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Q1T7F1 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Q1T7F1 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q1T7F1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q1T7F1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q1T7F1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q1T7F1 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q1T7F1 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q1T7F1 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q1T7F1 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q1T7F1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Q1T7F1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Q1T7F1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q1T7F1 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q1T7F1 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q1T7F1 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q1T7F1 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q1T7F1 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q1T7F1 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q1T7F1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q1T7F1 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q1T7F1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q1T7F1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q1T7F1 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q1T7F1 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q1T7F1 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Q1T7F1 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q1T7F1 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q1T7F1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q1T7F1 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q1T7F1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q1T7F1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q1T7F1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q1T7F1 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q1T7F1 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q1T7F1 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q1T7F1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q1T7F1 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q1T7F1 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q1T7F1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q1T7F1 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q1T7F1 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q1T7F1 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q1T7F1 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q1T7F1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q1T7F1 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q1T7F1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q1T7F1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q1T7F1 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q1T7F1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q1T7F1 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q1T7F1 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q1T7F1 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q1T7F1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q1T7F1 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q1T7F1 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q1T7F1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q1T7F1 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q1T7F1 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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