Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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GEN1Q17RS7 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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