Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPROQ16827 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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