Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 AC022087.1-201ENST00000558372 612 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 AC069503.1-202ENST00000616576 642 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 RPS26-201ENST00000356464 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 PAICSP2-201ENST00000429118 1150 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 AC114550.1-202ENST00000522661 643 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 TRMT13-201ENST00000370139 711 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
FOXD1Q16676 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 AC108718.1-201ENST00000482382 554 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 AC012370.2-204ENST00000601940 1320 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
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