Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTF1Q16619 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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