Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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