Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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