Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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CDSNQ15517 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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CDSNQ15517 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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CDSNQ15517 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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CDSNQ15517 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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CDSNQ15517 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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CDSNQ15517 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CDSNQ15517 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CDSNQ15517 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CDSNQ15517 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CDSNQ15517 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDSNQ15517 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDSNQ15517 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDSNQ15517 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDSNQ15517 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDSNQ15517 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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